PDB Viewer: Molecole 3D

PDB Viewer trasforma il tuo telefono in un microscopio molecolare. Cerca nell'intera Protein Data Bank e in oltre 200 milioni di previsioni AlphaFold, ed esplora qualsiasi proteina, virus, farmaco o molecola di DNA in 3D interattivo — gratis, senza account, senza pubblicità e senza registrazione.

DA DOVE ARRIVANO LE MOLECOLE

• RCSB Protein Data Bank — oltre 200.000 strutture determinate sperimentalmente

• AlphaFold — oltre 200 milioni di modelli previsti dall'IA

• SWISS-MODEL — modelli per omologia

• PubChem e ChEMBL — milioni di farmaci e composti

• Crystallography Open Database — cristalli di piccole molecole

• NCI/CADD — digita un nome chimico e ottieni un modello 3D

Ogni fonte è gratuita e non richiede una chiave API. Puoi anche aprire i tuoi file .pdb e .cif.

MODI DI VISUALIZZARE

• Cinque rappresentazioni: fil di ferro, sfere e bastoncini, sfere (CPK), nastro/cartoon e una superficie molecolare liscia

• Colora per elemento, catena, struttura secondaria, arcobaleno o affidabilità AlphaFold (pLDDT)

• Assemblaggi biologici: ricostruisci un intero capside virale da poche catene

• Insiemi NMR: sovrapponi tutti i modelli per vedere una proteina muoversi

• Rilevamento automatico della struttura secondaria

PENSATO PER IL TOCCO

• Ruota, zooma e sposta con rendering nativo fluido

• Tocca un atomo per vederne elemento, residuo e catena

• Le strutture viste di recente vengono memorizzate e funzionano offline

Per studenti, ricercatori, insegnanti e curiosi. PDB Viewer rende la biologia strutturale bella e accessibile.

Le strutture provengono dai rispettivi database. PDB Viewer è indipendente e non è affiliato né approvato da RCSB PDB, EMBL-EBI o AlphaFold.