PDB Viewer: Moléculas 3D

PDB Viewer convierte tu teléfono en un microscopio molecular. Busca en toda la Protein Data Bank y en más de 200 millones de predicciones de AlphaFold, y explora cualquier proteína, virus, fármaco o molécula de ADN en 3D interactivo: gratis, sin cuenta, sin anuncios y sin registro.

DE DÓNDE VIENEN LAS MOLÉCULAS

• RCSB Protein Data Bank: más de 200.000 estructuras determinadas experimentalmente

• AlphaFold: más de 200 millones de modelos predichos por IA

• SWISS-MODEL: modelos por homología

• PubChem y ChEMBL: millones de fármacos y compuestos

• Crystallography Open Database: cristales de moléculas pequeñas

• NCI/CADD: escribe un nombre químico y obtén un modelo 3D

Todas las fuentes son gratuitas y no necesitan clave de API. También puedes abrir tus propios archivos .pdb y .cif.

FORMAS DE VERLO

• Cinco representaciones: alambre, bolas y varillas, esferas (CPK), cinta/cartoon y una superficie molecular suave

• Colorea por elemento, cadena, estructura secundaria, arcoíris o confianza de AlphaFold (pLDDT)

• Ensamblajes biológicos: reconstruye una cápside viral completa a partir de unas pocas cadenas

• Conjuntos de RMN: superpón todos los modelos para ver moverse una proteína

• Detección automática de la estructura secundaria

DISEÑADO PARA LA PANTALLA TÁCTIL

• Gira, amplía y desplázate con renderizado nativo y fluido

• Toca cualquier átomo para ver su elemento, residuo y cadena

• Las estructuras vistas recientemente se guardan en caché y funcionan sin conexión

Para estudiantes, investigadores, docentes y curiosos. PDB Viewer hace que la biología estructural sea bella y accesible.

Las estructuras proceden de sus respectivas bases de datos. PDB Viewer es independiente y no está afiliado ni respaldado por la RCSB PDB, el EMBL-EBI ni AlphaFold.