PDB Viewer: 3D-Moleküle

PDB Viewer verwandelt dein Telefon in ein molekulares Mikroskop. Durchsuche die komplette Protein Data Bank und über 200 Millionen AlphaFold-Vorhersagen und erkunde jedes Protein, Virus, Medikament oder DNA-Molekül in interaktivem 3D – kostenlos, ohne Konto, ohne Werbung und ohne Anmeldung.

WOHER DIE MOLEKÜLE STAMMEN

• RCSB Protein Data Bank – über 200.000 experimentell bestimmte Strukturen

• AlphaFold – über 200 Mio. KI-vorhergesagte Proteinmodelle

• SWISS-MODEL – homologiebasierte Modelle

• PubChem und ChEMBL – Millionen von Medikamenten und Verbindungen

• Crystallography Open Database – Kristalle kleiner Moleküle

• NCI/CADD – gib einen chemischen Namen ein und erhalte ein 3D-Modell

Jede Quelle ist kostenlos und benötigt keinen API-Schlüssel. Du kannst auch eigene .pdb- und .cif-Dateien öffnen.

DARSTELLUNGEN

• Fünf Darstellungen: Drahtmodell, Kugel-Stab, Kalottenmodell (CPK), Cartoon/Ribbon und eine glatte Moleküloberfläche

• Färbe nach Element, Kette, Sekundärstruktur, Regenbogen oder AlphaFold-Konfidenz (pLDDT)

• Biologische Einheiten: baue ein komplettes ikosaedrisches Viruskapsid aus wenigen Ketten nach

• NMR-Ensembles: überlagere alle Modelle und beobachte, wie ein Protein sich bewegt

• Automatische Erkennung der Sekundärstruktur

FÜR DEN TOUCHSCREEN GEMACHT

• Drehen, Zoomen und Verschieben mit flüssigem nativem Rendering

• Tippe ein Atom an und sieh Element, Aminosäure-Rest und Kette

• Zuletzt angesehene Strukturen werden zwischengespeichert und funktionieren offline

Für Studierende, Forschende, Lehrende und alle Neugierigen. PDB Viewer macht Strukturbiologie schön und zugänglich.

Die Strukturen stammen aus den jeweiligen Datenbanken. PDB Viewer ist unabhängig und steht in keiner Verbindung zur RCSB PDB, zum EMBL-EBI oder zu AlphaFold.